Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP5LA4QPB2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms