Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms