Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTC7B-201ENST00000328459 19458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDCP-202ENST00000406895 3700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 LIN28B-201ENST00000345080 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 EXOC5-211ENST00000621441 10589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPFIA2-220ENST00000550584 5405 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBCK-201ENST00000273980 8101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 GMDS-AS1-202ENST00000505870 8217 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms