Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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PGGT1BP53609 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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PGGT1BP53609 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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