Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM217B-201ENST00000358293 5152 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 PKP4-AS1-201ENST00000342892 4067 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 AGBL3-203ENST00000436302 3533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 CYP8B1-201ENST00000316161 3974 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 KIAA1671-206ENST00000637069 6510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 KIF6-202ENST00000287152 9082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 PAK6-201ENST00000260404 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 IGFN1-202ENST00000335211 11810 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 GYS1-202ENST00000323798 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 SART3-201ENST00000228284 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ROBO1-204ENST00000467549 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 PKNOX1-203ENST00000432907 5180 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 AC242022.1-201ENST00000638002 1565 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 MYO6-203ENST00000369981 8692 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 CAST-234ENST00000511049 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 VIT-202ENST00000379242 2810 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 SIPA1L1-211ENST00000555818 7831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 CUL4A-212ENST00000617546 5666 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 RASGRP1-213ENST00000561180 2707 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 DPY19L3-201ENST00000342179 6015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF266-202ENST00000588221 3503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 PTPN7-201ENST00000309017 3765 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 GRM1-207ENST00000507907 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC28A1-204ENST00000538177 2155 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF619-202ENST00000429348 4104 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC02177-201ENST00000564305 5298 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 ASTN1-202ENST00000361833 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AL135999.1-201ENST00000555968 3243 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNB2-201ENST00000523207 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 NLRP2-214ENST00000543010 3576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 ESRRG-207ENST00000366940 5314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 CIZ1-228ENST00000634901 3462 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 SPATA19-201ENST00000299140 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP69-201ENST00000364477 117 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU1-8P-201ENST00000384328 165 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RNVU1-1-201ENST00000384610 164 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AC023141.10-201ENST00000415634 200 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AL031848.1-201ENST00000419034 351 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01015-204ENST00000445296 399 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL308P-201ENST00000464971 297 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 GLRXP3-201ENST00000470810 321 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL272P-201ENST00000487762 289 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AC107959.3-202ENST00000523806 450 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AC084121.2-201ENST00000528788 264 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AP004833.3-201ENST00000531893 322 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL786P-201ENST00000579130 298 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR7162-201ENST00000611134 69 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 DEF8-201ENST00000268676 3725 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 TYK2-201ENST00000264818 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 TMTC4-202ENST00000342624 3602 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.2 ms