Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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PTPRNQ16849 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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PTPRNQ16849 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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PTPRNQ16849 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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PTPRNQ16849 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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PTPRNQ16849 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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