Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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COL19A1Q14993 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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COL19A1Q14993 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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COL19A1Q14993 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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COL19A1Q14993 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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COL19A1Q14993 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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COL19A1Q14993 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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COL19A1Q14993 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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COL19A1Q14993 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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COL19A1Q14993 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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COL19A1Q14993 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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COL19A1Q14993 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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COL19A1Q14993 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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COL19A1Q14993 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL19A1Q14993 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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