Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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