Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX39BQ13838 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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