Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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SEMA3FQ13275 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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SEMA3FQ13275 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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SEMA3FQ13275 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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SEMA3FQ13275 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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SEMA3FQ13275 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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SEMA3FQ13275 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3FQ13275 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
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