Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRIM28Q13263 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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