Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ4

KRTAP9-2, Keratin-associated protein 9-2, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-2Q9BYQ4 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 PCDH15-224ENST00000612394 5765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 ADAM3A-202ENST00000460383 2528 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 NAP1L3-202ENST00000475430 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 SEC31A-227ENST00000508502 3801 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 CACNA1S-202ENST00000367338 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 IGSF1-205ENST00000370904 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 LRRC37A6P-202ENST00000448648 5444 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF320-201ENST00000391781 6074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 DBF4B-201ENST00000315005 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 LIN54-202ENST00000442461 4254 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 ALPK1-205ENST00000504176 5203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 LAMA1-201ENST00000389658 9657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 ARHGEF7-208ENST00000426073 4921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 UNC79-201ENST00000256339 8400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 GON4L-217ENST00000615926 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 SEC16A-203ENST00000313050 8806 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 ITGA11-202ENST00000423218 10192 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 FAM13A-201ENST00000264344 5858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 PDPR-210ENST00000568530 7223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 HFE-207ENST00000357618 5286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 CNR2-201ENST00000374472 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 DDIAS-207ENST00000528759 3278 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC015813.3-201ENST00000584805 6113 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 MON2-214ENST00000641654 10382 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 PCDH19-201ENST00000255531 7937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 PCDH19-203ENST00000420881 7936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 UBE2N-205ENST00000550657 3018 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 ADAM22-205ENST00000398209 9144 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 EIF4E2-202ENST00000409098 3448 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 Metazoa_SRP.108-201ENST00000621610 300 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 GOLGA8B-202ENST00000438958 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-2Q9BYQ4 S1PR3-202ENST00000375846 8505 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-2Q9BYQ4 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-2Q9BYQ4 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-2Q9BYQ4 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-2Q9BYQ4 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-2Q9BYQ4 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-2Q9BYQ4 LIMCH1-203ENST00000396595 5740 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-2Q9BYQ4 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-2Q9BYQ4 MECP2-201ENST00000303391 10505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-2Q9BYQ4 ADIPOQ-202ENST00000444204 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-2Q9BYQ4 DNASE1-202ENST00000407479 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-2Q9BYQ4 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-2Q9BYQ4 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-2Q9BYQ4 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-2Q9BYQ4 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZWILCH-201ENST00000307897 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-2Q9BYQ4 KIFAP3-203ENST00000367767 2718 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-2Q9BYQ4 RGS4-203ENST00000367909 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.5 ms