Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
RBM42Q9BTD8 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
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