Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
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SHPRHQ149N8 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
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SHPRHQ149N8 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC1.1□□□□□ -2.23
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SHPRHQ149N8 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SHPRHQ149N8 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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SHPRHQ149N8 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.24
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SHPRHQ149N8 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
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SHPRHQ149N8 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
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SHPRHQ149N8 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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SHPRHQ149N8 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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SHPRHQ149N8 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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SHPRHQ149N8 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
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SHPRHQ149N8 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
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SHPRHQ149N8 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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