Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TROQ12816 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TROQ12816 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TROQ12816 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TROQ12816 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TROQ12816 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TROQ12816 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TROQ12816 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TROQ12816 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TROQ12816 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TROQ12816 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TROQ12816 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
TROQ12816 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TROQ12816 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TROQ12816 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TROQ12816 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TROQ12816 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TROQ12816 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TROQ12816 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TROQ12816 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
TROQ12816 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TROQ12816 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
TROQ12816 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TROQ12816 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TROQ12816 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TROQ12816 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TROQ12816 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TROQ12816 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TROQ12816 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
TROQ12816 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TROQ12816 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
TROQ12816 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
TROQ12816 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
TROQ12816 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TROQ12816 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
TROQ12816 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TROQ12816 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
TROQ12816 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TROQ12816 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TROQ12816 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TROQ12816 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TROQ12816 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
TROQ12816 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
TROQ12816 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
TROQ12816 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
TROQ12816 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
TROQ12816 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TROQ12816 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TROQ12816 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TROQ12816 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TROQ12816 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
TROQ12816 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TROQ12816 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TROQ12816 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TROQ12816 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TROQ12816 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
TROQ12816 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TROQ12816 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TROQ12816 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TROQ12816 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TROQ12816 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TROQ12816 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TROQ12816 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TROQ12816 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TROQ12816 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TROQ12816 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TROQ12816 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TROQ12816 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TROQ12816 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TROQ12816 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TROQ12816 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TROQ12816 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TROQ12816 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TROQ12816 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TROQ12816 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TROQ12816 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TROQ12816 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TROQ12816 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TROQ12816 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TROQ12816 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TROQ12816 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TROQ12816 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
TROQ12816 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TROQ12816 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TROQ12816 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TROQ12816 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TROQ12816 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TROQ12816 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TROQ12816 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TROQ12816 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TROQ12816 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TROQ12816 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TROQ12816 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TROQ12816 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
TROQ12816 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TROQ12816 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
TROQ12816 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TROQ12816 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
TROQ12816 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TROQ12816 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms