Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 TBX5-202ENST00000349716 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 TEX14-201ENST00000240361 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 PLS3-202ENST00000355899 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 BICC1-202ENST00000373886 5475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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HOXD11P31277 USP32P2-201ENST00000412260 4329 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 HERC4-202ENST00000373700 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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HOXD11P31277 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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HOXD11P31277 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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HOXD11P31277 LRRC37A-201ENST00000320254 5177 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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HOXD11P31277 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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HOXD11P31277 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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HOXD11P31277 NCKAP1L-201ENST00000293373 9016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 EFCAB8-204ENST00000618684 435 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 IQCA1-204ENST00000409907 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 ITPK1-AS1-201ENST00000553639 4701 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD11P31277 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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