Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
IKZF1Q13422 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
IKZF1Q13422 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IKZF1Q13422 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
IKZF1Q13422 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IKZF1Q13422 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
IKZF1Q13422 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IKZF1Q13422 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IKZF1Q13422 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
IKZF1Q13422 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms