Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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FOXC1Q12948 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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FOXC1Q12948 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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FOXC1Q12948 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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FOXC1Q12948 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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FOXC1Q12948 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXC1Q12948 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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