Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DNASE1L3Q13609 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms