Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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E2F4Q16254 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
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E2F4Q16254 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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E2F4Q16254 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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E2F4Q16254 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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E2F4Q16254 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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E2F4Q16254 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
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