Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KIF5AQ12840 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms