Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HDGFL3Q9Y3E1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms