Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED7Q9Y3B3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms