Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GIT1Q9Y2X7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GIT1Q9Y2X7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GIT1Q9Y2X7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GIT1Q9Y2X7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIT1Q9Y2X7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms