Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms