Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC6Q9Y210 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms