Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SHANK2Q9UPX8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHANK2Q9UPX8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms