Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRXN1Q9ULB1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms