Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MKLN1Q9UL63 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms