Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms