Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms