Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RCAN3Q9UKA8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms