Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP21Q9UK80 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP21Q9UK80 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms