Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBE1Q9UJT0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBE1Q9UJT0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms