Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
IFT172Q9UG01 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms