Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APEX2Q9UBZ4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APEX2Q9UBZ4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms