Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS29Q9UBQ0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS29Q9UBQ0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms