Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EHD3Q9NZN3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms