Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms