Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms