Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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FAM53CQ9NYF3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM53CQ9NYF3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM53CQ9NYF3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM53CQ9NYF3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM53CQ9NYF3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM53CQ9NYF3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM53CQ9NYF3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM53CQ9NYF3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM53CQ9NYF3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM53CQ9NYF3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM53CQ9NYF3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM53CQ9NYF3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM53CQ9NYF3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM53CQ9NYF3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FAM53CQ9NYF3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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