Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK13-1Q9NX77 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms