Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM248Q9NWD8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms