Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms