Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TM7SF3Q9NS93 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms