Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TOPORSQ9NS56 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TOPORSQ9NS56 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOPORSQ9NS56 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOPORSQ9NS56 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOPORSQ9NS56 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOPORSQ9NS56 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOPORSQ9NS56 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOPORSQ9NS56 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOPORSQ9NS56 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOPORSQ9NS56 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOPORSQ9NS56 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOPORSQ9NS56 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOPORSQ9NS56 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOPORSQ9NS56 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TOPORSQ9NS56 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TOPORSQ9NS56 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOPORSQ9NS56 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOPORSQ9NS56 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOPORSQ9NS56 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOPORSQ9NS56 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TOPORSQ9NS56 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOPORSQ9NS56 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOPORSQ9NS56 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOPORSQ9NS56 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOPORSQ9NS56 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOPORSQ9NS56 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOPORSQ9NS56 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TOPORSQ9NS56 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms