Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GPHNQ9NQX3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPHNQ9NQX3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms