Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYLDQ9NQC7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
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