Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SEMA4BQ9NPR2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms