Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A4GALTQ9NPC4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms